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华为云:病毒基因组实时分析平台 提升疑似病例的确诊效率

来自: 网络|发布时间: 2020-02-15 20:38:35|浏览量:457| 评论: 0

2月13日,华为云联合希望组正式发布病毒基因组实时分析平台,该平台覆盖病毒样本采集、病毒基因测序、数据传输、数据分析及展现全业务流程。(延伸阅读:华为云推出新冠肺炎AI辅助诊断服务,CT量化结果秒级输出)


与传统方案相比,该平台具有更便携、检测过程更快、更智能的优势,适合于在大范围内同时开展疫情的检测工作,将极大提升疑似病例的确诊效率,助力疫情防控。



便携


单人可携带,随时随地进行基因采样、测序


新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的肺炎疫情暴发以来,传统试剂盒(荧光定量PCR核酸检测试剂盒)在患者临床诊断和疑似患者排查中发挥了重要作用, 但是该方法对检测环境有严格要求:


▸需要对样本集中送检,实验室检测能力有限


▸无法满足当前快速增长的疑似患者的排查、诊断需求


基于希望组的纳米孔测序方案:


使用小型化测序设备,单人即可携带,克服了场地限制,可以在各临时医疗工作站、患者现场进行基因采样和测序,为患者确诊提供快速检测手段,缩短患者等待时间、缓解检测压力,有效抑制疫情的进一步扩散。



实时


5G网络实时上传数据,快速完成病毒分析


在没有固定IT基础设施的临时医疗站,或缺少有线网络和本地计算资源的工作点,只能人工将采集的资源送递到集中站点处理,时效性差。


希望组与华为5G、华为云团队一起完成了实时机动的测序数据上传,并依托华为云基因容器的高性能:


✎ 自动化测序分析引擎和海量的计算资源


✎ 病毒数据的远程上传、分析,实现数据的实时采集、实时分析、实时上报


该方案能够无缝扩展到其他病原的检测和监测,符合传染性病原疫情的早发现,早隔离,迅速切断传播路径的防控理念。



智能


检测病毒基因组变异,精准定位突变位点


此外,对病毒基因组学和流行病学进行实时和快速研究也是疫情防控中最重要也是容易缺失的一环。


例如:


截止到2月13日,全国确诊阳性患者达到59,000多例,但是全球所有新冠状病毒的基因组数据却只有87个,这对全球了解新冠状病毒的产生,传播(包括时间和空间溯源),演化以及病毒毒力和感染力的研究造成了巨大的困难。



而这些研究对于检测方案的研发,相应疫苗和药物研发具有重大意义,并且能够为疫情防控决策提供科学支持,其和诊断治疗同样重要甚至更为重要。


希望组基于ONT第三代测序技术结合华为云基因容器+AI容器的实时病毒基因组检测平台能够在数小时之内同时完成样本检测以及病毒基因组变异检测。


突破了包括实时荧光RT-PCR和传统第二代测序技术在内的现有检测技术的局限以及对场地、外界环境的限制、提升了流程检测的便携性和测序效率,并推进病毒检测和基因组变异监测工作全面下移,能够更好地服务于新冠状病毒的疫情防控,为广大人民的健康保驾护航。

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